Program Tahunan GPK dijalankan sebagai persediaan kepada para pelajar menghadapi Ujian Penilaian Kelas KAFA (UPKK).
Justeru, Program GPK SAR KAFA Masjid Saidina Othman Ibnu Affan adalah seperti berikut.
1. Kelas Tambahan UPKK
2. Bengkel Jawi UPKK
3. Penghayatan Cara Hidup Islam & amali Solat UPKK
4. Bengkel Aqidah UPKK
5. Bengkel Sirah UPKK
6. Ujian Praktikal Amali Solat, Hafazan Surah, Doa tahun 1-5
7. Peperiksaan Pertengahan Tahun
8. Bengkel Bahasa Arab UPKK
9. Bengkel Akhlak UPKK
10.Riadah UPKK
11.Ujian Tilawah dan Hafazan UPKK
12.Solat Hajat UPKK
13.Peperiksaan Akhir Tahun
14. Yaumul Ihtifal
Aktiviti Ko-kurikulum pula dijalankan sebagai selingan dan tambahan kepada aktiviti pembelajaran utama.
Aktiviti Ko-kurikulum Tahunan SAR KAFA Masjid Saidina Othman Ibnu Affan pula adalah seperti berikut :
1. Sambutan Maulidur Rasul
2. Kem Mandi Wajib Tahun 4 & 5
3. Sambutan Hari Guru
4. Puasa Sunat Bulan Syaaban
5. Program Tadarus dan Khatam Al-Quran pada bulan Ramadhan
6. Jamuan Hari Raya
